U rodinného auta není asistenčních systémů pro ochranu před nebezpečnými situacemi nikdy dost. Octavia si například poradí s těmito situacemi: sleduje provoz v protisměru a pokud hrozí nebezpečí při odbočování na křižovatce doleva, zastaví. Jakmile zaparkujete, sleduje prostor za Vámi a varuje Vás, pokud při otevírání dveří hrozí srážka s jiným vozem nebo cyklistou.

V případě nehody chrání posádku odolná karoserie se štědře dimenzovanými deformačními zónami a až 10 airbagy. Ta je pečlivě sladěna s tříbodovými bezpečnostními pásy a bezpečnostními opěrkami hlavy. K dalším bezpečnostním prvkům patří moderní elektronické systémy, navržené pro předcházení nehodám – například multikolizní brzda a systém proaktivní ochrany cestujících.

Octavia Combi je vybavena systémem eCall, který poskytuje informace typu polohy vozu, počtu pasažérů, pozice vozu před a po nehodě i stavu v případě nehody. Dá se také aktivovat ručně díky tlačítkům ve střešním modulu.

V hodnocení Euro NCAP získala Octavia maximální možné hodnocení pěti hvězd, čímž potvrdila optimální ochranu celé své posádky.

V kategorii ochrany dětí získala Octavia 88 procent z možných bodů. Tím se zařadila mezi nejlepší vozy, které kdy prošly testováním. V kategorii ochrany dospělých získala Octavia 92 procent.