Ve výrobních závodech se jedná o energii elektrickou, stlačený vzduch i teplo dodané v teplé vodě či zemní plyn. Významným krokem se stalo zavedení inteligentní regulace výkonu ve výrobě či zavedení LED osvětlení v provozech. Společnost také významně investuje do výstavby nových technologií a budov, kdy pro každou novou investici platí povinná zásada použití nejlepší dostupné techniky (Best Available Technique – BAT). V roce 2020 tak například vznikl první střešní fotovoltaický systém společnosti Škoda Auto jako podporovaný projekt „Instalace nízkouhlíkové technologie“ na střechách Servisního centra v Kosmonosech.

Škoda Auto klade velký důraz na bezpečné nakládání s látkami, které mohou v případě úniku ohrozit půdu či podzemní vody. Pokud je to technologicky možné, upřednostňuje méně nebezpečné látky a snaží se minimalizovat spotřebu vody na vyrobený vůz. Množství opakovaně použité vody (recyklované vody) dosahuje více než 45 % celkové spotřeby.

V oblasti odpadového hospodářství společnost důsledně dodržuje hierarchii nakládání s odpady, kdy se v první řadě snaží předcházet vzniku odpadů. Pokud odpady vzniknou, jsou přednostně předávány k materiálovému či energetickému využití. Výsledkem tohoto úsilí je, že již od roku 2020 v českých výrobních závodech Škoda Auto nevznikají žádné odpady ve výrobě určené ke skladování.

Škoda Auto využívá pro provoz více než 60% elektřiny z obnovitelných zdrojů, neboť nákup této komodity provádí s certifikátem nulových emisí CO_2. Na cestě k dosažení uhlíkové neutrality se povedlo učinit významný milník. Tím je spuštění projektu modernizace teplárny ŠKO-ENERGO, která zásobuje automobilku a město Mladou Boleslav energiemi a teplem. V rámci snížení uhlíkové stopy bude teplárna využívat jako palivo výhradně biomasu.