Turbodmychadlem přeplňovaný osmiventilový čtyřválec 1,2 TSI se poprvé představil v modelu Yeti. Modelová řada Fabia jej nabízí ve výkonových verzích 63 kW a 77 kW. Oproti původním atmosférickým agregátům dosahují nová TSI nižší spotřeby paliva a emisí CO2, lepší zrychlení a vyšší maximální rychlost. Pro obě výkonové verze je k dispozici pětistupňová manuální převodovka MQ 200, pro motor 1,2 TSI/77 kW lze zvolit také 7° automatickou převodovku DSG.

Nabídku naftových motorů představují agregáty 1,6 TDI CR/55 kW a 1,6 TDI CR DPF ve výkonových verzích 66 kW a 77 kW (místo 1,4 TDI PD/59 kW a 1,9 TDI PD/77 kW). Nový motor je v obou variantách nabízen ve spojení s filtrem pevných částic a plní emisní limity EU5. Mezi jeho nejvýznamnější technické inovace patří vysokotlaké přímé vstřikování paliva systémem common-rail a čtyřventilová technika. Nové motory jsou proto mnohem tišší, mají kultivovanější chod a nižší spotřebu.

Pro všechny motorizace jsou k dispozici manuální 5° převodovky, které vynikají tradičně přesným a lehkým řazením i krátkými dráhami. Zcela nová automatická převodovka je nabízena pro nejsilnější benzinovou motorizaci 1,2 TSI/77 kW. Původní 6° automatickou převodovku Tiptronic nyní nahrazuje 7° dvouspojková automatická převodovka DSG, známá z modelových řad Octavia, Yeti a Superb.